Ахборот-таҳлил бошқармаси қуйидаги вазифаларни бажаради:
➖ фармацевтика тармоғини ривожлантириш бўйича республика миқёсида ва Соғлиқни сақлаш вазирлиги томонидан қабул қилинган чора-тадбирлар ижросининг натижадорлигини тизимли таҳлил қилиб бориш;
➖ норматив-ҳуқуқий ҳужжатларда Агентликка юклатилган вазифаларнинг ижроси мониторингини олиб бориш ва умумлаштириш;
➖ Ўзбекистон Республикаси Президентининг Агентликка юклатилган топшириқларнинг ижроси мониторингини олиб бориш, таҳлил қилиш ва умумлаштириш;
➖ Агентлик марказий аппарати бошқармалари, ҳудудий бўлинмалари ва идоравий ташкилотларига ахборот-таҳлил соҳасида услубий раҳбарликни амалга ошириш.